Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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