Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vax2Q9WTP9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vax2Q9WTP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms