Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms