Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vav3Q9R0C8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms