Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AmfrQ9R049 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms