Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nphs1Q9QZS7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nphs1Q9QZS7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nphs1Q9QZS7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nphs1Q9QZS7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nphs1Q9QZS7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphs1Q9QZS7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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