Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf4Q9QZS2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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