Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ndrg3Q9QYF9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms