Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irx4Q9QY61 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms