Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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