Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms