Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms