Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms