Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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