Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cntn6Q9JMB8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cntn6Q9JMB8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn6Q9JMB8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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