Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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