Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col5a3Q9JLI2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms