Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rfx5Q9JL61 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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