Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms