Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl39Q9JKF7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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