Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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