Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms