Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cog8Q9JJA2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog8Q9JJA2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms