Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms