Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms