Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lmbr1Q9JIT0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms