Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms