Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Pgpep1Q9ESW8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Pgpep1Q9ESW8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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