Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aff4Q9ESC8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms