Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms