Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rapgef4Q9EQZ6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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