Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SgshQ9EQ08 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms