Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak1ip1Q9DCE5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms