Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xab2Q9DCD2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms