Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne8Q9DC53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms