Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd2Q9DBX3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd2Q9DBX3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Susd2Q9DBX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Susd2Q9DBX3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms