Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf6Q9DBU5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms