Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Med29Q9DB91 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms