Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smg9Q9DB90 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg9Q9DB90 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg9Q9DB90 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smg9Q9DB90 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smg9Q9DB90 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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