Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms