Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samd8Q9DA37 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Samd8Q9DA37 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd8Q9DA37 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms