Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms