Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd9Q9D9M4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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