Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmco5aQ9D9D5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tmco5aQ9D9D5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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