Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms