Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms