Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf13Q9D777 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms