Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms