Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rtl8cQ9D6I0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rtl8cQ9D6I0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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