Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sdr42e1Q9D665 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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